避免解决办法
- 转录水平RNA高通量研究为人们深入了解生物学过程中转录调控、信号转导机制、疾病分子病理分型等提供了重要的研究方法。常用的高通量研究方法如基因芯片、RNA测序等,可产生大量信息,然而这些技术对样品质量要求很高,同时费用昂贵。且其实验结果往往需要做qPCR进行验证。然而在对多基因进行定量研究时,传统的qPCR方法由于实验操作步骤多且繁复,通量明显不足,无法满足多重基因定量检测的需求。此外,临床样品通常为FFPE样本,在制备和储存过程中会造成大量RNA降解、断裂。因此,qPCR及RNA-seq都难以对这种样本进行精确定量分析。针对以上问题,NanoString给出了完美的解决方案:基于杂交原理建立的NanoString数字化基因分析系统直接检测条形码探针标记的单个mRNA转录子,并通过数字计数进行定量。此过程无需酶促和扩增过程。仅需100 ng的RNA即可对逾八百个特异的mRNA转录子进行准确的定量。其检测的敏感性和准确性与实时定量PCR(RT—PCR) 技术相当。
- NanoString技术可以不经过RNA提取,直接在FFPE样本,细胞裂解液乃至全血中对RNA进行定量,进一步降低由于提取过程可能带来的潜在偏差。近年来,NanoString技术被越来越广泛地应用到生物医学前沿领域,包括高通量基因表达结果验证、基因表达谱研究、基因调控网络研究、临床疾病分子分型及诊断预后等领域。
NanoString新技术特征
- 阿拉伯数码化科技-单氧分子阿拉伯数码式直接性筛选,可以于阿拉伯数码化科技剖析或核验2代测序所判定的总体目标高精准服务度-不要大逆转录、 PCR扩张,可以直接探测RNA分子结构数据,能够 染色体表达方式情况报告高灵敏度- 飞摩尔(10-15)级别灵敏度,与qPCR匹敌诸多监测工具- 单管最长可也监测工具800种计划氧分子自动式化水平高- 只需要六个轻松手动挡作业使用方法,上限水平逃避由人的因素的要素样本量兼容模式高- 高效化查测FFPE包埋切成片,随时查测血管和肿瘤细胞裂解液等,不可RNA取出纯化采用密切- Gene Expression, miRNA Expression, miRGE, CNV, Gene Fusion, Single Cell Expression, Protein, RNA & Protein共探测nCounter SPRINTnCounter Pro
- 技术原理
- 操作流程
- 结果分析nSolver™ Analysis SoftwareROSALIND® Platform
- 针对不同通路所生成的热图细胞因子和趋化因子通路JAK-STAT信号通路NF-kappaB信号通路Wnt信号通路
- 不同通路基因在火山图中的表现细胞因子和趋化因子通路JAK-STAT信号通路NF-kappaB信号通路Wnt信号通路